Center for Kønsidentitet, den offentlige enhed, der udreder og behandler dem fra 18 år og derover med kønsdysfori i Danmark. København, Odense og Aalborg har hvert sit center. Behandlingen af dem under 18 er centraliseret og sker i samarbejde mellem Region Hovedstadens Kompetencecenter for Kønsidentitet hos Børn og Unge (Børne- og Ungdomspsykiatrisk Center) og Rigshospitalet. Der kræves udredning og en diagnose, før medicinsk eller kirurgisk behandling kan tilbydes – til forskel fra juridisk kønsskifte, hvor personens underskrift er nok.